Inizialmente i biscotti erano chiamati “biscottini delle monache di Novara” perchè nei monasteri femminili del novarese nel XVI secolo alcune monache avrebbero inventato la ricetta del biscotto mentre si accingevano a preparare delle ghiottonerie nei propri laboratori per i forestieri di passaggio. Quando per volere di Bonaparte i monasteri vennero chiusi alcune monache cambiarono vita e prestarono servizio presso le famiglie benestanti del luogo; iniziarono così a diffondere la conoscenza delle loro ricette tra cui quella dei biscottini. La ricetta venne messa in commercio da un droghiere della zona e si diffusero man man presso diversi maestri pasticceri che ne migliorarono le tecniche di cottura e di  conservazione. I biscottini di Novara vennero spediti in altre zone e sempre più lontano. La storia dei Biscottini di Novara è anche legata alla storia del Carnevale novarese e della maschera di “Re Biscottino”.